代謝組學是指細胞、組織、器官或者生物體內的所有小分子代謝組分（主要是相對分子量1000以內的內源性小分子）的集合。代謝組學分為靶向代謝組學和非靶向代謝組學。

　　

　　新陳代謝網絡是十分復雜的網絡，而人體的代謝網絡尤為復雜。現(xiàn)在多數(shù)信號通路的研究都是集中在代謝網絡的一個很小的領域?；蚪M學、蛋白組學研究雖然已經揭示了部分調節(jié)通路，但是和代謝網絡直接相關的是代謝產物。從茫茫多的代謝產物中選取研究對象，無疑是大海撈針。非靶向性代謝組學又稱為發(fā)現(xiàn)代謝組學，主要是將對照組和實驗組的代謝組（某一生物體的全部代謝物）進行比對，以找出其代謝物的差異。

　　

　　非靶向代謝組學流程中，第一步對樣品進行前處理，提取代謝物；之后使用MS或者NMR對這些代謝物進行檢測獲取原始數(shù)據；原始數(shù)據經過數(shù)據處理之后轉換成可供下一步數(shù)據分析的數(shù)據矩陣，通常在這個數(shù)據集中行數(shù)對應樣本的個數(shù)，列數(shù)對應變量（代謝物信號）的個數(shù)。接著，對數(shù)據集進行數(shù)據分析包括數(shù)據前處理和具體的分析，最終獲得代謝標記物。